عملکرد بخش مرمت در ترمیم آثار فرهنگی و هنری به این‌ صورت است که بدون دخالت در ساختار اصلی اثر و با استفاده از روش‌های کاملاً علمی، اصالت آن برای آیندگان حفظ می‌شود.

تمامی آثاری که وارد کارگاه می‌شوند، ابتدا عکس‌برداری‌ شده و شناسنامه‌ای شامل اطلاعات تاریخی، فن‌شناسی و آسیب‌شناسی (ازلحاظ بیولوژیکی، فیزیکی و شیمیایی) برای آنها تهیه می‌شود. پس از مستندسازی و ثبت اطلاعات، مرمت و درمان اثر براساس نوع آسیب و جنس آن انجام می‌‌گیرد.

همچنین، خدماتی مانند صحافی، مرمت جلد، مایلورکشی، پاسپارتو، ساخت قاب، جعبه و آلبوم‌های حفاظتی و رحل نیز برای آثار در این کارگاه طراحی و اجرا می‌شود.

نظر به اهمیت تصاویر به‌عنوان اسنادی ارزشمند و ماندگار، مرکز اسناد و کتابخانه بنیاد ایران‌شناسی به‌منظور ساماندهی و آسیب‌شناسی نگاتیوهای عکاسی پایه‌شیشه‌ای و همچنین فیلم‌نگاتیوهای تاریخی موجود در کتابخانه، ضمن دعوت از کارشناسان پژوهشکده حفاظت و مرمت آثار تاریخی در ارائه پیشنهادهایی برای حفاظت و مرمت این آثار، اقدام به حفاظت از فیلم‌نگاتیوها با ساخت پاکت‌های حفاظتی فاقد اسید در کارگاه مرمت کرده است.

این پاکت‌ها پس از قرار گرفتن فیلم‌نگاتیوها درون آنها، در جعبه‌های مخصوصی که در همین بخش ساخته می‌شوند، نگهداری خواهند شد.